Une partie importante de l'apprentissage qui a lieu dans le cadre de l'animation socio-éducative est liée aux compétences organisationnelles telles que la capacité de coopérer, de prendre des responsabilités et de résoudre des conflits. C'est pourquoi l'animation socio-éducative ne consiste pas à organiser les jeunes, mais à les aider à s'auto-organiser. La capacité à s'auto-organiser est également importante pour gagner en autonomie et sa promotion est également essentielle pour développer et maintenir une société civile forte.